Genómica Equipo de prueba de principios

Biografías de nuestros científicos PoP

El equipo de prueba de principios (PoP) de Beckman Coulter Life Sciences está disponible para optimizar nuestros productos químicos de extracción y purificación genómica a fin de crear soluciones para su laboratorio.

Dra. Han Wei, B.M.E.D.

Científica PoP desde 2017.

Han fue investigador asociado y becario postdoctoral en la Universidad de Indiana. Donde ella identificó nuevos genes resistentes al carboplatino en el cáncer de ovario mediante una técnica de mutagénesis insercional basada en la validación (VBIM). También descubrió un novedoso sitio de fosforilación en el complejo NF-κB; este sitio funciona como un potencial objetivo terapéutico para la prevención y el tratamiento de enfermedades inflamatorias y cánceres impulsados por el NF-κB. Finalmente, ella caracterizó las consecuencias de las modificaciones postranslacionales (PTM) del NF-κB y descubrió que la proteína arginina metiltransferasa 5 (PRMT5) es responsable de las PTM, lo que implicó una nueva estrategia para el tratamiento del cáncer.

Han recibió su Doctorado de Filosofía en Bioquímica y Biología Molecular en la Universidad de Graduados de la Academia China de Ciencias, en Beijing, China y su Maestría de Medicina en Toxicología en la Academia de Ciencias Médicas Militares, en Beijing, China. Ella también recibió una Licenciatura de Medicina en Medicina Clínica (B.M.E.D., equivalente a M.D.) en la Universidad Médica del Sur, en Guangdong, China.

Publicaciones seleccionadas:

  • Hartley A, Wei H, Prabhu L, et al. NF-kB: Its role in colorectal cancer.In Role of Transcription Factors in Gastrointestinal Malignancies. 2018;247-260. Springer Sinapore. doi:10.1007/978-981-10-6728-0_17.
  • Martin M, Wei H, Lu T. Targeting microenvironment in cancer therapeutics. Oncotarget 2016; 7 (32): 52575-83. doi:10.18632/oncotarget.9824.
  • Wang B, Wei H, Prabhu L, et al. Role of novel serine 316 phosphorylation of the p65 subunit of NF-κB in differential gene regulation. J Biol Chem 2015;290 (33): 20336-47. doi:10.1074/jbc.M115.639849.
  • Wei H, Wang B, Miyagi M, et al. PRMT5 dimethylates R30 of the p65 subunit to activate NF-κB. Proc Natl Acad Sci U S A 2013;110 (33): 13516-21. doi:10.1073/pnas.1311784110.
  • Wei H, Mundade R, Lange KC, Lu T. Protein arginine methylation of non-histone proteins and its role in diseases. Cell Cycle 2014;13 (1): 32-41. doi:10.4161/cc.27353.

Presentaciones seleccionadas:

  • Han Wei, Brittany Niccum, Li Liu, Mary Blair, Randy Pares. Automated genomic DNA extraction from large volume whole blood. San Antonia, Texas, March 23-26, 2019 (Poster).
  • Han Wei, Brittany Niccum, Zach Smith, Jimmy Adediran. Simultaneously DNA and RNA extraction from formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) tissue. San Antonia, Texas, March 23-26, 2019 (Poster).
  • Han Wei. Number of Fusions Detected in FFPE Cancer Tissue Depends on RNA Isolation Method. Next Generation Dx Summit, Washington, D.C., Augest 20- 24 Aug, 2018 (Oral Presentation).
  • Han Wei, Yun She, Tao Lu. Identification of novel carboplatin resistance gene in ovarian cancer. American Association for Cancer Research Annual Meeting, San Diego, CA, April 5-9, 2014 (Poster).
  • Han Wei. Regulation of NF-κB by PRMT5 - dependent arginine methylation of p65. Pharmacology & Toxicology Spring 2014 Seminar Series, Indianapolis, IN, February 7, 2014 (Oral Presentation).

Dra. Brittany Niccum

Científica Pop/Científica de aplicaciones de marketing desde 2018.

Brittany fue becaria de posdoctorado en la Universidad Tufts, donde desarrolló una técnica novedosa para realizar experimentos de evolución a largo plazo en microbiomas. También utilizó la RNA-seq y la secuenciación de ADN para analizar los genomas y transcriptomas de los microbiomas, y contribuyó al desarrollo del repollo como un sistema modelo gnotobiótico.

Recibió su doctorado en microbiología en la Universidad de Indiana y su licenciatura en ciencias matemáticas en el Instituto de Tecnología de Florida.

Publicaciones seleccionadas:

  • Foster PL, Niccum BA, Popodi E, et al. Determinants of base-pair substitution patterns revealed by whole-genome sequencing of DNA mismatch repair defective Escherichia coli. Genetics 2018; 209 (4): 1029-1042. doi:10.1534/genetics.118.301237.
  • Miller ER, Kearns PJ, Niccum BA, et al. Establisment limitation constrains the abundance of lactic acid bacteria in the Napa cabbage phyllosphere. Appl Environ Microbiol 2019;85 (13): e00269-19. doi:10.1128/AEM.00269-19.
  • Niccum BA, Lee H, Mohammedlsmail W, et al. The spectrum of replication errors in the absence of error correction assayed across the whole genome of Escherichia coli. Genetics 2018;209 (4): 1043-1054. doi:10.1534/genetics.117.300515.
  • Niccum BA, Poteau R, Hamman GE, et al. On an unbiased and consistent estimator for mutation rates. J Theor Biol 2012;300: 360-367. doi:10.1016/j.jtbi.2012.01.029.
  • Niccum BA, Mohammedlsmail W, Tang H, Foster PL. Thesymmetrical wave pattern of base-pair substitution rates across the Escherichia coli chromosome has multiple causes. MBio 2019;10 (4): e01226-19. doi:10.1128/mBio.01226-19.

Dra. Lauren Saunders

Científica PoP de 2017 a 2019. Investigación y desarrollo desde 2019.

Lauren fue becaria de postdoctorado en el Centro Nacional de Investigación de la Utilización Agrícola (USDA) trabajando en biocombustibles y bioproducción. Durante ese tiempo, descubrió una nueva especie de bacilo que produce un inhibidor de crecimiento del lactobacilo, tanto en suspensión como en forma de biopelículas. Ella aisló el inhibidor, caracterizó su actividad con una variedad de bacterias diferentes y desarrolló una cepa de bacilo mutante para ayudar en la purificación del inhibidor. También trabajó en la producción de una plataforma química, lactona de ácido triacético, a partir de una variedad de cepas de levadura industrial. Ella duplicó la titulación de lo que se había visto anteriormente y trabajó para identificar y disminuir los subproductos.

Recibió su doctorado en biofísica molecular y bioquímica en la Universidad de Yale trabajando en cinética de las proteínas. Es licenciada en biología y química por la Universidad de Cornell.

Publicaciones seleccionadas:

  • Saunders LP, Ouellette A, Bandle R, et al. Identification of small-molecule inhibitors of autotaxin that inhibit melanoma cell migration and invasion. Mol Cancer Ther 2008;7 (10): 3352-62. doi:10.1158/1535-7163.MCT-08-0463.
  • Saunders LP, Bischoff KM, Bowman MJ, Leathers TD. Inhibition of Lactobacillus biofilm growth in fuel ethanol fermentations by Bacillus. Bioresour Technol 2019;272: 156-161. doi:10.1016/j.biortech.2018.10.016.
  • Saunders LP, Bowman MJ, Mertens JA, et al. Triacetic acid lactone production in industrial Saccharomyces yeast strains. J Ind Microbiol Biotechnol 2015;42 (5): 711-21. doi:10.1007/s10295-015-1596-7.
  • Saunders LP, Sen S, Wilkinson BJ, Gatto C. Insights into the mechanism of homeoviscous adaptation to low temperature in branched-chain fatty acid-containing bacteria through modeling FabH kinetics from the foodborne pathogen Listeria monocytogenes. Front Microbiol 2016;7 (1386). doi:10.3389/fmicb.2016.01386.
  • Saunders LP, Cao W, Chang WC, et al. Kinetic analysis of autotaxin reveals substrate-specific catalytic pathways and a mechanism for lysophosphatidic acid distribution. J Biol Chem 2011;286 (34): 30130-41. doi:10.1074/jbc.M111.246884.

Presentaciones seleccionadas:

  • Lauren P. Saunders and Asmita Patel. Correlation between mutations found in FFPE tumor tissue and paired cfDNA samples. AACR April 2019 (Poster).
  • Lauren P. Saunders, Antonia Hur, Brittany Niccum, and Asmita Patel. A new automated method for the extraction of cfDNA. AGBT February 2019 (Poster).
  • Danielle Fowler, Anna Zhang, Kathleen Lincoln, James Tanner, Philip Gorman, Deborah Webb, ZhongFu Huang, Peng Sun, Marisa Spencer, Russell McSweeney, Lauren P. Saunders, Nick Morgan, Christopher Odom, Steven Kerr, Christina Bartlett. Establishing North America’s first ‘tissue to cDNA’ automated workflow for qPCR analysis of target genes using the Beckman Coulter i7 advanced robotics platform. SLAS February 2019 (Poster).
  • Lauren P. Saunders. Isolation and Separation of DNA and RNA from a single tissue sample. FOG London Jan 2019 (Oral Presentation).

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